تعد شعبة ضمان الجودة والأداء الجامعي من الشعب المهمة في كلية الصيدلة حيث تقوم بمجموعة من المهام والأعمال والبرامج الإلكترونية ومنها ( برنامج تقييم الاداء للمنتسبين السنوي ــ برنامج ترميز المختبرات ــ تقييم الأداء المؤسسي ) وغيرها من البرامج التي من أهمها هي انجاز عملية تقييم المنتسبين في الكلية من ( التدريسيين والموظفين ) ورقيا والكترونيا وإكمال المصادقات اللازمة لها ومن المهام الأخرى لشعبة ضمان الجودة هي المختبرات العلمية في الكلية من حيث جودتها والتأكد من سلامتها وحصولها على كافة الاحتياجات المطلوبة للمختبر للوصول به الى أعلى درجة لخدمة الطلبة والحركة العلمية بالإضافة الى بقية المهام الإدارية والمكتبية .