تعتبر كلية الهندسة من الكليات الحديثة التي تم استحداثها في جامعة ميسان في عام 2012 من اجل تهيئة كوادر هندسية تخصصية لتغطية متطلبان النهوض الاقتصادي والتكنولوجي الذي يتطلع إليه عراقنا الحبيب. ومن الجدير بالذكر ان كلية الهندسة حالياً تضم أربع تخصصات هندسية هي: (هندسة النفط , الهندسة المدنية ,الهندسة الكهربائية والهندسة الميكانيكية). حيث تمثل هذه التخصصات حاجة البلد الفعلية بشكل عام وحاجة محافظة ميسان بشكل خاص لرفد حقل العمل بكوادر هندسية ذات خبرة عالية بحسب طبيعة المناهج الدراسية والمختبرات الرصينة التي اعتمدها الكلية والتي تضاهي احدث الجامعات الهندسية في العالم . إن كلية الهندسة ستبقى بعون الله الرافد الحيوي للكادر الهندسي لبلدنا العزيز. مدة الدراسة الأولية فيها أربع سنوات يمنح فيها المتخرج بعدها شهادة بكالوريوس هندسة.